Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SHHQ15465 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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