Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL19A1Q14993 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms