Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms