Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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