Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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