Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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