Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SP140Q13342 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SP140Q13342 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SP140Q13342 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
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