Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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