Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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GPS1Q13098 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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