Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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BNIP1Q12981 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BNIP1Q12981 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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