Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LMAN2Q12907 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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