Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NUP160Q12769 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms