Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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LRRTM2O43300 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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