Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms