Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ZBED3Q96IU2 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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ZBED3Q96IU2 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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ZBED3Q96IU2 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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ZBED3Q96IU2 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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ZBED3Q96IU2 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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