Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms