Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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SGCAQ16586 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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