Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms