Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F4Q16254 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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