Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
TAF1AQ15573 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms