Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHHQ15465 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHHQ15465 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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