Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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