Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDCD1Q15116 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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