Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms