Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C1DQ13901 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C1DQ13901 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
C1DQ13901 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1DQ13901 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1DQ13901 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1DQ13901 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms