Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
APOFQ13790 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
APOFQ13790 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
APOFQ13790 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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