Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NCOA4Q13772 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NCOA4Q13772 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms