Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALCAMQ13740 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ALCAMQ13740 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALCAMQ13740 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms