| FHL3 | Q13643 | AC110774.1-201 | ENST00000623567 | 2018 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | DNAH6-201 | ENST00000237449 | 12666 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | IQGAP2-202 | ENST00000379730 | 5442 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MBNL1-218 | ENST00000485910 | 4257 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | TBC1D31-210 | ENST00000521676 | 3256 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
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| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.404-201 | ENST00000383978 | 102 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6ATAC23P-201 | ENST00000408448 | 123 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| FHL3 | Q13643 | SNORA57.3-201 | ENST00000411095 | 141 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | U2.22-201 | ENST00000636441 | 106 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | SUCNR1-201 | ENST00000362032 | 4181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MS4A1-212 | ENST00000534668 | 3475 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | BRCA2-201 | ENST00000380152 | 11986 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | ETV1-202 | ENST00000399357 | 6096 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | FAT3-204 | ENST00000525166 | 18699 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTND5P30-201 | ENST00000452896 | 1731 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MBD5-202 | ENST00000407073 | 9512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC128685.1-201 | ENST00000490357 | 1834 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORD114-19-201 | ENST00000363072 | 75 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1141P-201 | ENST00000364520 | 107 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.527-201 | ENST00000384573 | 102 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.574-201 | ENST00000384766 | 95 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR200C-201 | ENST00000384980 | 68 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP171-201 | ENST00000391071 | 115 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.645-201 | ENST00000391229 | 102 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MS4A4E-201 | ENST00000398984 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTCYBP2-201 | ENST00000407745 | 171 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SKP156-201 | ENST00000410308 | 342 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC01349-201 | ENST00000416343 | 497 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | MS4A4E-203 | ENST00000425663 | 350 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPL21P40-201 | ENST00000428586 | 483 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | CEP57L1P1-201 | ENST00000430943 | 1201 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC133865.1-201 | ENST00000438619 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |