Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TUBB3Q13509 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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