Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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