Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SF3B2Q13435 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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