Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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