Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms