Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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CNTN1Q12860 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNTN1Q12860 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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