Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
BPTFQ12830 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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