Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PGGT1BP53609 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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