Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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