Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRDP23468 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PTPRDP23468 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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