Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms