Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r10W4VSP8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms