Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pus1Q9WU56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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