Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms