Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh13Q9WTR5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms