Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpv2Q9WTR1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms