Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Npas3Q9QZQ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Npas3Q9QZQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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