Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms