Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms