Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpsf3Q9QXK7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpsf3Q9QXK7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms