Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rai2Q9QVY8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms